Warsztaty PestSpace Nanopore Barcoding

22 12 2025

 18–19 grudnia 2025 r. Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych Uniwersytetu Warszawskiego (CNBCh UW) było gospodarzem warsztatów PestSpace poświęconych wykorzystaniu technologii nanopore do genetycznego kodowania kreskowego (barcodingu) próbek roślinnych. W wydarzeniu wzięli udział wszyscy polscy partnerzy projektu, w tym przedstawiciele HR Smolice oraz Instytutu Genetyki Roślin Polskiej Akademii Nauk.

Warsztaty poprowadzili naukowcy z Wydziału Biologii UW. Część laboratoryjna była prowadzona przez dr Martę Tischer oraz Maksymiliana Nowaka, którzy przeprowadzili uczestników przez praktyczne etapy przygotowania i opracowywania próbek z wykorzystaniem urządzeń nanopore.

Moduł bioinformatyczny, skoncentrowany na przetwarzaniu i analizie danych, poprowadził dr Mikołaj Dziurzyński, również z Uniwersytetu Warszawskiego.

Podczas dwudniowych warsztatów uczestnicy przetworzyli i przeanalizowali 48 próbek bobiku, zebranych w trakcie letnich badań terenowych. Uzyskane dane stanowią cenny wkład w trwające badania PestSpace, których celem jest opracowanie nowoczesnych narzędzi do monitorowania chorób roślin i szkodników.

Atmosfera warsztatów była bardzo współpracująca i angażująca. Uczestnicy mieli wiele okazji do wymiany doświadczeń, dyskusji nad wyzwaniami metodologicznymi oraz wspólnej pracy nad zadaniami analitycznymi.

 

Projekt “PestSpace – Improving resilience to the spread of plant diseases via a regional Pest Common Data Space”,  uzyskał finansowanie w ramach programu Interreg Baltic Sea Region. Jego celem jest stworzenie aplikacji, która pomoże w szybkiej identyfikacji patogenów i szkodników upraw.

Aktualne działania można śledzić na stronie: https://interreg-baltic.eu/project/pestspace/.