Laboratorium Biologii Obliczeniowej
O Grupie:
Zajmujemy się rozwijaniem i wykorzystaniem komputerowych narzędzi do badania trójwymiarowej struktury biomolekuł oraz ich dynamiki. Nasze zainteresowania obejmują szerokie zagadnienia z dziedziny biologii obliczeniowej, od modelowania molekularnego do analizy danych biologicznych. Więcej o nas na stronie laboratorium: http://lcbio.pl/
Działalność badawcza:
- przewidywanie struktury białek i kompleksów białkowych
- dokowanie molekularne: białko-peptyd, białko-białko, białko- mała cząsteczka
- dynamika molekularna: metody pełno-atomowe i gruboziarniste
- rozwój narzędzi obliczeniowych: łatwe w użyciu web serwisy i zaawansowane aplikacje standalone
- projektowanie leków w oparciu o strukturę celu
- racjonalne projektowanie białek
- bioinformatyczne wsparcie badań eksperymentalnych
- biostatystyka
- naukowe bazy danych
- analiza danych
Oferta:
- Wspomaganie projektowania leków przy użyciu metod komputerowych;
- Wspomaganie badań w zakresie biologii strukturalnej przy użyciu metod bioinformatycznych oraz modelowania molekularnego;
- Rozwój oprogramowania dedykowanego do symulacji białek i innych systemów biologicznych;
- Rozwój serwisów internetowych do komputerowego wspomagania projektowania leków oraz wspomagania badań biologicznych;
- Rozwój biologicznych baz danych;
- Analiza oraz przewidywanie właściwości białek;
- Modelowanie i inżynieria białek;
- Statystyczna analiza danych biologicznych;
- Zastosowanie superkomputera do symulacji systemów biologicznych;
- Zastosowanie superkomputera do analizy danych biologicznych;
- Wizualizacja danych biologicznych.
Kierownik grupy:
dr hab. Sebastian Kmiecik, prof. ucz.
otrzymał tytuł doktora w 2007 roku na Wydziale Chemii, Uniwersytetu Warszawskiego. W latach 2007-2010 pracował w biotechnologicznej firmie Selvita gdzie kierował projektami badawczo-rozwojowymi obejmującymi rozwój oprogramowania oraz usługi komputerowego wspierania projektowania leków. Od 2010 roku zajmował się rozwojem nowych metod modelowania wieloskalowego białek na Wydziale Chemii, Uniwersytetu Warszawskiego. W 2015 roku Sebastian Kmiecik otrzymał tytuł doktora habilitowanego, a w 2016 roku nagrodę Ministra Nauki i Szkolnictwa Wyższego za osiągnięcia naukowe I stopnia.